Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms