Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc38Q8CDN8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc38Q8CDN8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccdc38Q8CDN8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccdc38Q8CDN8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccdc38Q8CDN8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccdc38Q8CDN8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ccdc38Q8CDN8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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