Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms