Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms