Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms