Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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