Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Pggt1bQ8BUY9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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