Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms