Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubash3bQ8BGG7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubash3bQ8BGG7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms