Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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