Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms