Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms