Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2q1Q7TSS2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ube2q1Q7TSS2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms