Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Clec18aQ7TSQ1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Clec18aQ7TSQ1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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