Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms