Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek5Q7TSC3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek5Q7TSC3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms