Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms