Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms