Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms