Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc154Q6RUT8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc154Q6RUT8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms