Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms