Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms