Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms