Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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