Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms