Protein–RNA interactions for Protein: Q61481

Pde1a, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1aQ61481 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pde1aQ61481 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pde1aQ61481 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pde1aQ61481 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pde1aQ61481 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pde1aQ61481 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pde1aQ61481 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pde1aQ61481 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pde1aQ61481 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pde1aQ61481 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1aQ61481 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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