Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms