Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Xrcc1Q60596 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Xrcc1Q60596 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Xrcc1Q60596 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Xrcc1Q60596 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Xrcc1Q60596 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Xrcc1Q60596 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Xrcc1Q60596 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Xrcc1Q60596 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Xrcc1Q60596 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Xrcc1Q60596 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Xrcc1Q60596 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Xrcc1Q60596 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc1Q60596 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xrcc1Q60596 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xrcc1Q60596 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms