Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms