Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms