Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf608Q56A10 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf608Q56A10 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms