Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd5Q3V1H9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms