Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms