Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Ppp4r3cQ3V0Y1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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