Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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