Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Parp3Q3ULW8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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