Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms