Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rnf180Q3U827 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rnf180Q3U827 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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Rnf180Q3U827 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Rnf180Q3U827 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Rnf180Q3U827 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Rnf180Q3U827 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Rnf180Q3U827 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Rnf180Q3U827 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf180Q3U827 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf180Q3U827 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf180Q3U827 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf180Q3U827 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf180Q3U827 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf180Q3U827 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf180Q3U827 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf180Q3U827 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf180Q3U827 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf180Q3U827 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf180Q3U827 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf180Q3U827 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf180Q3U827 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf180Q3U827 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms