Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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1700066B19RikQ3TS39 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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1700066B19RikQ3TS39 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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1700066B19RikQ3TS39 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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1700066B19RikQ3TS39 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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1700066B19RikQ3TS39 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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1700066B19RikQ3TS39 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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1700066B19RikQ3TS39 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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1700066B19RikQ3TS39 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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1700066B19RikQ3TS39 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700066B19RikQ3TS39 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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