Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afvQ3THW5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afvQ3THW5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms