Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam107bQ3TGF2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam107bQ3TGF2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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