Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Cpne9Q1RLL3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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