Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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