Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Rpusd2Q149F1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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Rpusd2Q149F1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Rpusd2Q149F1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Rpusd2Q149F1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Rpusd2Q149F1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rpusd2Q149F1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rpusd2Q149F1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rpusd2Q149F1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rpusd2Q149F1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Rpusd2Q149F1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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