Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.165e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-211ENST00000487873 464 ntTSL 313.82□□□□□ -0.25e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 AC011530.1-204ENST00000595946 321 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.81□□□□□ -0.25e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 AC011530.1-202ENST00000596586 397 ntAPPRIS P5 TSL 213.81□□□□□ -0.25e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.345e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.863e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-204ENST00000446773 1496 ntTSL 1 (best)18.69■□□□□ 0.583e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.453e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-206ENST00000463794 445 ntTSL 316.38■□□□□ 0.213e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-210ENST00000484551 613 ntTSL 316.38■□□□□ 0.213e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-212ENST00000488383 1337 ntTSL 515.84■□□□□ 0.133e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-213ENST00000493705 715 ntTSL 515.78■□□□□ 0.123e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.143e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-227ENST00000533243 1558 ntTSL 220.04■□□□□ 0.86e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.716e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-207ENST00000540763 799 ntTSL 319.2■□□□□ 0.666e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-211ENST00000544429 574 ntTSL 418.89■□□□□ 0.616e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-204ENST00000536079 765 ntTSL 217.64■□□□□ 0.416e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.266e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-212ENST00000544738 956 ntTSL 516.14■□□□□ 0.176e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-202ENST00000354291 1004 ntTSL 515.87■□□□□ 0.136e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-220ENST00000529455 840 ntTSL 515.24■□□□□ 0.036e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.056e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.136e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-226ENST00000532478 940 ntTSL 513.81□□□□□ -0.26e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-209ENST00000542286 2767 ntTSL 213.68□□□□□ -0.226e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-213ENST00000545042 450 ntTSL 513.2□□□□□ -0.36e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-201ENST00000395449 1772 ntTSL 513.16□□□□□ -0.36e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.426e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-214ENST00000527927 850 ntTSL 512.09□□□□□ -0.476e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-225ENST00000532438 740 ntTSL 411.56□□□□□ -0.566e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-205ENST00000524782 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.736e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-213ENST00000527776 709 ntTSL 210.17□□□□□ -0.786e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-210ENST00000526342 474 ntTSL 59.25□□□□□ -0.936e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 INO80-206ENST00000559995 566 ntTSL 54.46□□□□□ -1.76e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PPDPF-204ENST00000473620 478 ntTSL 218.96■□□□□ 0.633e-6■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PPDPF-203ENST00000464438 373 ntTSL 218.53■□□□□ 0.563e-6■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 SEMA4G-204ENST00000484128 714 ntTSL 211.22□□□□□ -0.615e-9■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 SEMA4G-212ENST00000613292 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.625e-9■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 SEMA4G-203ENST00000476171 393 ntTSL 311.11□□□□□ -0.635e-9■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.229e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.169e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.169e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.099e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 OTUD5-205ENST00000455452 2077 ntTSL 520.11■□□□□ 0.819e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.279e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 RER1-208ENST00000493207 686 ntTSL 216.64■□□□□ 0.259e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.169e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 TAF12-204ENST00000495422 624 ntTSL 514.02□□□□□ -0.179e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 ANKRD52-203ENST00000548241 651 ntTSL 312.84□□□□□ -0.359e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.399e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 OTUD5-207ENST00000484499 924 ntTSL 59.41□□□□□ -0.99e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.059e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 F11-AS1-202ENST00000508110 1512 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.059e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 CHD7-206ENST00000527900 398 ntTSL 38.46□□□□□ -1.069e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 CHD7-203ENST00000525508 4777 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.099e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.199e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.419e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.429e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.649e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 F11-AS1-203ENST00000508287 669 ntTSL 33.95□□□□□ -1.789e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 CHD7-205ENST00000527825 434 ntTSL 33.95□□□□□ -1.789e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.912e-7■□□□□ 8
ILF3Q12906 ANKLE2-207ENST00000539605 10890 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.022e-7■□□□□ 8
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