Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc39dQ0VF76 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms