Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms