Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf541Q0GGX2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms