Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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