Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms